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    液體活檢是否能取代組織活檢?
    發(fā)布時(shí)間:2017/01/05 信息來源:查看
    Perthera是由喬治梅森大學(xué)研究人員Emanuel Petricoin和風(fēng)投家Dendy Young在2013年創(chuàng)立的個(gè)體化醫(yī)療公司。Perthera本身并不做實(shí)驗(yàn)分析,而是作為中間收集和運(yùn)送腫瘤患者樣本的經(jīng)銷商,幫助醫(yī)生從分子檢測公司獲取基因組、蛋白組等信息。同時(shí),Perthera也在建立一個(gè)患者治療史和檢測結(jié)果的數(shù)據(jù)庫,用于指導(dǎo)輔助患者治療。
    近期,Perthera公司的研究人員在《Oncotarget》上發(fā)表了一項(xiàng)研究,在胰腺癌患者中比較液體活檢和組織活檢的結(jié)果。他們發(fā)現(xiàn)兩種方法之間存在顯著的不一致性,這表明,目前組織活檢仍然是腫瘤診斷的金標(biāo)準(zhǔn),液體活檢還不能取代組織活檢。
    胰腺癌患者中的液體活檢和組織活檢結(jié)果不一致
    首先,研究人員使用兩種基于血液的NGS檢測方法分析34名胰腺癌患者:其中26名患者接受Guardant Health公司的Guardant360檢測,該檢測基于Illumina HiSeq 2500平臺(tái)對(duì)cfDNA進(jìn)行68-基因panel進(jìn)行測序;8名患者接受Cynvenio公司的ClearID檢測,該檢測基于Thermo Fisher IonTorrent PGM平臺(tái)上對(duì)50個(gè)基因進(jìn)行panel測序。此外,在這34名患者中,23名患者使用Foundation Medicine的FoundationOne進(jìn)行腫瘤組織活檢,該檢測基于Illumina HiSeq 2500平臺(tái)對(duì)321個(gè)基因進(jìn)行panel測序。
    結(jié)果顯示,液體活檢在19名患者中平均檢測了2個(gè)基因突變,而組織活檢在每名患者中平均檢測到13個(gè)基因突變,造成該結(jié)果的原因可能是由于組織活檢所檢測的基因較多。
    研究人員還在同時(shí)接受了液體活檢和組織活檢的23名患者中比較了胰腺癌中四種常見突變基因的結(jié)果。他們發(fā)現(xiàn)9名患者(39%)的KRAS變異結(jié)果較一致,但是液體活檢并沒有發(fā)現(xiàn)組織活檢所檢測到的14個(gè)KRAS變異;同時(shí),6名患者(26%)的TP53變異結(jié)果較一致,但是血液檢測并沒有發(fā)現(xiàn)組織活檢所檢測到的15個(gè)TP53變異;另外,血液活檢沒有檢測到CDKN2A或SMAD4突變,而組織活檢分別在11名和6名患者中檢測到這兩種突變。
    文章作者Petricoin說,由于 KRAS突變發(fā)生在約90%的胰腺癌患者中,該突變的結(jié)果能說明一項(xiàng)檢測的敏感性,因此,KRAS結(jié)果的不一致需要引起足夠重視。
    然而,Guardant Health的高級(jí)醫(yī)療主管和實(shí)驗(yàn)室主任Justin Odegaard表示,這項(xiàng)研究中的患者并不適合用Guardant360檢測來分析。該研究中幾乎所有的受試者在液體活檢前都接受了化療,這種治療可能對(duì)cfDNA的水平具有強(qiáng)烈的影響,而且部分受試者對(duì)目前的治療已經(jīng)產(chǎn)生反應(yīng)或病情趨于穩(wěn)定。Guardant360檢測的目的是用來為患者選擇治療方法,主要用于剛開始接受治療或病情進(jìn)展后考慮更換治療方法的患者。
    接下來,研究者分析了17名具有較高腫瘤負(fù)擔(dān)和病情進(jìn)展的患者發(fā)現(xiàn),液體活檢檢測到KRAS突變的比例有所提高:41%(17名中的7名)VS 29%(34名中的10名),但還是低于預(yù)期。相比之下,這17名患者中有9名進(jìn)行了組織活檢,其中7名中檢測到KRAS突變(78%)。
    Petricoin表示,盡管該研究中觀察到的液體活檢和組織活檢結(jié)果不一致,然而,尤其是對(duì)組織活檢較難操作的腫瘤而言,液體活檢仍然是患者腫瘤信息的重要來源。
    參考文獻(xiàn):A pilot study evaluating concordance between blood-based and patient-matched tumor molecular testing within pancreatic cancer patients participating in the Know Your Tumor (KYT) initiative. DOI:10.18632/oncotarget.13225

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