總 期 數(shù):52 期
辦 學(xué) 歷 史:16 年(2002 年-2017 年)
開 班 時 間:2017 年 8 月 18 日-8 月 25 日(18 日為全天報到日,19 日開始上課)
上 課 地 點:杭州 浙江大學(xué)華家池校區(qū)
隨著眾多生物基因組測序項目的完成,生物學(xué)數(shù)據(jù)正在加速度增長。如何科學(xué)地分析和注釋這些高通量數(shù)據(jù),已成為生物學(xué)工作者急需學(xué)習(xí)和解決的問題。
浙江大學(xué)「基因組科學(xué)」研習(xí)班邀請北京基因組所于軍教授、胡松年教授為您講授基因組學(xué)基礎(chǔ)知識和前沿進展、基因轉(zhuǎn)錄組的測定及分析、二代測序等實驗技術(shù)的關(guān)鍵事項;浙江大學(xué)楊軍教授、陳銘教授等講解系統(tǒng)生物學(xué)及高通量分析研究方法和思路。
浙江大學(xué)基因組科學(xué)研習(xí)班多次獲得浙江大學(xué)優(yōu)秀項目創(chuàng)新獎,目前已舉辦 51 期,學(xué)員來自全國 30 余個省市,累計培訓(xùn)學(xué)員 5100 余名。每次研習(xí)班不乏教授、博導(dǎo)參加,更受到博士后、碩博生等年輕學(xué)者的青睞。
他們中有一些帶著課題或問題前來交流和聯(lián)系,不少學(xué)員通過本研習(xí)班建立了長期協(xié)作關(guān)系,共同申請國家 973、863 課題,共同發(fā)表論文,其中不少優(yōu)秀的研究成果,已在 SCI 期刊上發(fā)表。
一、浙江大學(xué)基因組科學(xué)研習(xí)班上課內(nèi)容
上課內(nèi)容涵蓋「基因組學(xué)—蛋白質(zhì)組學(xué)—系統(tǒng)生物學(xué)」的研究方法、技術(shù)思路、前沿進展及其在各生物學(xué)科中的應(yīng)用。
浙江大學(xué)基因組科學(xué)研習(xí)班核心課程包括:
1. 基因組的比較研究、DNA 測序技術(shù)原理與進展(講課人:于 軍 教授)
2. 轉(zhuǎn)錄組的測定與分析、大規(guī)模測序方法及應(yīng)用、微生物基因組學(xué)、基因組學(xué)與精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)(講課人:胡松年教授)
3. 系統(tǒng)生物學(xué)建模分析及高通量分析技術(shù)應(yīng)用(講課人:楊軍、陳銘教授等)
4. 蛋白質(zhì)組學(xué)概論及應(yīng)用(講課人:鐘伯雄教授)
二、浙江大學(xué)基因組科學(xué)研習(xí)班上機內(nèi)容
上機實習(xí)課采用 「跟我學(xué)」方式,學(xué)習(xí)實踐各類基礎(chǔ)生物信息學(xué)軟件,每人一臺 PC 機跟著大屏幕一步步學(xué)會基因組、蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)分析的基本方法。
浙江大學(xué)基因組科學(xué)研習(xí)班主要內(nèi)容如下:
實習(xí)一: 基因組數(shù)據(jù)注釋和功能分析
通過序列比對工具 BLAST 的學(xué)習(xí),了解基因功能注釋的原理;介紹多序列聯(lián)配工具 ClustalX 及分子進化分析軟件 MEGA4,掌握系統(tǒng)發(fā)生樹繪制的基本方法,認(rèn)識基因復(fù)制在進化上的功能;學(xué)習(xí)基因序列分析常用的數(shù)據(jù)庫和軟件。
實習(xí)二: 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
介紹轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的基本流程及其原理;通過對 tophat、cufflinks、R 等轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析工具的介紹及演示,了解基于二代測序數(shù)據(jù)的轉(zhuǎn)錄組分析流程及常用分析方法; 利用 kegg、GOstat、DAVID 等在線工具挖掘轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的生物學(xué)意義。
實習(xí)三:系統(tǒng)生物學(xué)軟件實習(xí)-----網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)顯示與分析
利用 Cytoscape 系統(tǒng)生物學(xué)分析軟件,分析蛋白-蛋白相互作用,展示分子網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng),并與基因表達等數(shù)據(jù)整合。
實習(xí)四:蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能分析
從數(shù)據(jù)庫搜索感興趣的蛋白質(zhì)氨基酸序列開始,接著對蛋白質(zhì)基本理化性質(zhì)、二級結(jié)構(gòu)、和三維空間結(jié)構(gòu)和序列模體進行分析,預(yù)測目標(biāo)蛋白的生物功能。
實習(xí)五: 蛋白質(zhì)組質(zhì)譜分析
使用 X!Tandem、Mascot、Sequest 等軟件鑒定蛋白質(zhì)質(zhì)譜數(shù)據(jù),將質(zhì)譜結(jié)果匹配到蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫鑒定蛋白;使用 TPP 軟件包進行統(tǒng)計學(xué)分析和優(yōu)化檢索結(jié)果練習(xí)。
三、浙江大學(xué)基因組科學(xué)研習(xí)班培訓(xùn)對象
1. 無生物信息學(xué)背景,希望了解生物信息學(xué)的學(xué)員;
2. 計劃開展各類組學(xué)研究的科研人員;
3. 已有組學(xué)數(shù)據(jù)需了解分析方法的研究人員;
4. 有志從事生物信息學(xué)相關(guān)工作的學(xué)生或者技術(shù)人員。
四、浙江大學(xué)基因組科學(xué)研習(xí)班報名方法
若有參加意向,請直接將回執(zhí)發(fā)至 genetrain@zju.edu.cn,我們會即刻回函并在浙江大學(xué)繼續(xù)教育系統(tǒng)錄入,待排定課表后發(fā)給您詳細課程表。待您再次確認(rèn)后,發(fā)給您報到通知并排定上機號。培訓(xùn)結(jié)束,發(fā)放浙江大學(xué)繼續(xù)教育證書。(尚有少量名額,請盡快報名)
五、浙江大學(xué)基因組科學(xué)研習(xí)班教材 "DNA 和蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)分析工具」(第三版), 薛慶中等編著,科學(xué)出版社出版 2012 年 6 月發(fā)行。會務(wù)組提供。
聯(lián)系方式???? ?聯(lián) 系 人:代成林 18757558672?
電話:0571-88206579
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